表達DNA轉錄為mRNA，再翻譯為蛋白質。不可濫用。mRNA產生后不一定就能翻譯為蛋白質，如卵母細胞母源信息mRNA，受精卵發育初期才表。由mRNA被一些蛋白質結合，也可能其他原因如小分子RNA作用。

mRNA的選擇性運輸

細胞不同情況下選擇地將不同hnRNA加工成mRNA運至細胞質，--mRNA的選擇加工運輸,一種通核孔的主動運輸方式，可能機制大：1.依賴核孔復合體上受體蛋白對RNA分子的特異性識別，缺少識別信號便保留在核內；2.不需要識別信號，除被特別保留在核內的RNA外：其余RNA自動輸出細胞核；3.存在選擇輸出保留的聯合機制。

翻譯水平調節

主要是控制mRNA的穩定性和mRNA翻譯起始的調控。

所謂在翻譯水平上的調節，是說基因轉錄的各種mRNA并不都能翻譯成蛋白質，在不同細胞中有不同的mRNA得到翻譯，結果不同細胞具有不同的蛋白質，細胞內才有了差別（分化），是否有這種調節機制呢？

早就注意到在海膽未受精卵中存在著較穩定（未活化）的mRNA，這種mRNA只有在受精后才能翻譯，稱為母體mRNA（maternal mRNA）。推測這種mRNA可能在未受精卵中被蛋白質遮蓋，或被局限在細胞內某一特定區域而不能被翻譯。而在受精后從這類束縛中解放出來，開始翻譯成蛋白質。所以認為，在真核細胞對基因表達調節的一條重要途徑是產生穩定性的mRNA，處于隱蔽狀態，在一定條件下進行翻譯。

除了和蛋白結合，不導致能翻譯為蛋白外，這里我要重點提出miRNA，可以對翻譯水平上進行調節，使蛋白不表達或直接降解mRNA，主要研究的熱點是和腫瘤抑制基因和癌基因的關系。

mRNA代表基因轉錄水平，protein代表翻譯水平，表示功能，常常還要做免疫組化，進行組織定位和亞細胞定位，三者不能互相替換，

雖然說mRNA和蛋白水平是一個相偶聯的過程，但是兩者沒有必然的一致的趨勢，因此不一定mRNA水平升高了就一定蛋白濃度就會提高，反之亦然。mRNA水平升高代表的是啟動子或者增強子的激活，也許是上游轉錄因子的激活，而蛋白水平的提高則大多數和功能增強相偶聯。機體是一個相互協調一致的整體，因此兩者的變化往往是相互偶聯的，因此驗證兩者的關系對于確認某個基因的激活是相當有力的。

免疫組化或者免疫熒光都是反應細胞內某種蛋白定位或者形態學上的一個大致的變化趨勢的，并不能確切說明變化的形式，因此我認為如果缺少形態學的證據只要在蛋白水平驗證即可，畢竟都是反應蛋白水平的，當然反應細胞內定位的情況就另當別論了。

細胞中蛋白水平取決于：

1.基因拷貝數和基因表達水平

2.信使RNA翻譯為蛋白質的水平

3.蛋白質在體內降解的水平

基因表達有轉錄和翻譯兩個水平，但是調控就有很多水平，同一個基因可以有不同的轉錄本，而且mRNA可以有不同的剪接方式，因此一個基因可以有多個蛋白質。基因轉錄至mRNA其后再到蛋白質還有幾個水平的調控，也可能mRNA不需要翻譯為蛋白，就降解了，也可能翻譯到一定水平后，獲得另外的信號，而停止翻譯

從mRNA到protein是一個復雜的調控過程：這種現象我以前聽說過，mRNA水平轉錄增多，但有可能翻譯前降解增加，也可能沒有翻譯出功能蛋白。蛋白降低，可能降解加速（是特異性或非特異性），可能產生多聚體，要考慮檢測手段。最重要的是考慮你試驗設計這個大背景，考慮出現這種現象的特定意義

真核蛋白還存在一個翻譯后加工問題。如果翻譯后加工不正確，蛋白可能被內肽酶降解，也有可能活性降低。你可以做蛋白電泳，看蛋白的表達量是否變化.

轉錄和翻譯是兩個不同的過程，在某些特定的條件下可以脫節。但是首先要確定的確是mRNA升高，蛋白降低。請談談你在定量mRNA和蛋白表達水平時采用的方法！

機體存在生物鐘.即以24小時為周期,許多基因的表達在這段時間里存在峰值(量多)和谷值(量少).因此您研究的基因如果有周期波動,您的結果就wan全可能,因為有文獻報告蛋白的表達比mRNA滯后3小時左右,因此您在現有的采樣點后3小時再采樣,可能蛋白表達量就與已有結果mRNA高一致.